Plus une guerre n'est attribuée aux Mandaloriens depuis. Le reste de la galaxie n'avaient jusqu'alors aucune idée de l'existence des Mandaloriens car ils étaient restés depuis le début tapis dans le système Mandalore, restant renfermés sur eux-mêmes, peu soucieux de ce qui se passaient ailleurs dans l'univers: c'est pourquoi tpous ces évènements sont inconnus.
Pourtant les Mandaloriens sortirent de l'ombre. Sans trop que l'on sache pourquoi, mais probablement à cause de la gigantesque guerre civile, les Mandaloriens devinrent de moins en moins nombreux, et abandonnèrent finalement le système de Mandalore pour devenir des mercenaires nomades, voyageant la ou on leur avait demandé d'aller. Nul être dans la galaxie ne soupçonnait leur humanité, car ils ne se montraient jamais sans leurs armures et leurs casque, favorisant les rumeurs les plus effrayante à leur sujet.
Quelque 1000 ans avant la guerredes clones, un chasseur de primes nommé Durge s'introduisit dans un camp Mandalorien et tenta de tuer le leader des guerriers. Il se fit capturé et subît d'atroces tortures pendant des dizaines d'années. Il s'échappa enfin et plongea dans une hibernation réparatrice.
Les Mandaloriens qui n'étaient plus que quelques milliers furent engager pour régler des conflits un peu partout dans l'univers. Les Mandaloriens menés par un tout nouveau chef, Jaster Mereel, connurent une séparation. Les guerrier se scindèrent en deux clans : les Mandaloriens restés fidèles à Mereel, et the Death Watch, groupe mené par Viszla, un Mandalorien e froid avec Jaster et ses règles de commendement.
The Death Watch créa des armures nouvelles, variante de celles des Mandaloriens traditionnels. Les deux factions se livrèrent des combats sans merci, comme lorsque les Mandalorien durent se rendre sur Concord Dawn afin de mettre un terme à une guerre civile. Cette opération se transforma en chasse à l'homme lorsque Mereel et ses troupes se perdirent dans la nature. Viszla les traqua sans relâche et découvrît les fett. Cette famille de fermiers fut torturée par Viszla car ils avaient aidés Mereel à se cacher. Seul le fils cadet de la famille, nommé Jango, survécut en s'enfuyant et en tombant nez a nez avec Mereel et son groupe qu'il aida à s'enfuir. Mereel prit sur lui de recueillir et d'éduquer ce jeune graçon comme un vrai Mandalorien.
Au cour de la décenie suivante, les Mandaloriens et The Death Watch se livrèrent des combats sans merci, comme par exemple sur Khorda Six, ou Jaster Mereel perdit la vie, tué pa Viszla. Son héritier légitime, Jango Fett, âgé seulement de 20ans, prit la tête des mandaloriens, malgré les prtestation d'un guerrier du nom de Montross qui fut banni après avoir été reconnu comme partiellement responsable de la mort de Mereel. Les duels entre The Death Watch et les Mandaloriens se poursuivirent, lorsqu'un jour The Death Watch tendit un piège aux Mandaloriens : ils firent croire que Jango fett et ses troupes torturaient des peuples pacifiques sur Galidraan, et la république envoya sur place des centaines et des centaines de chevalier Jedi pour tuer les Mandaloriens. Ces derniers, bien que très puissant grâce à leurs armures, ne firent pas le poids et seul Jango Fett, survécut au massacre.
Grâce à lui, les Mandaloriens ne furent pas oubliés par le reste de la galaxie, car il devint chasseur de primes et ne se montrant jamais sans son armur de combat Mandalorienne, qui devint synonyme de précision et d'efficacité. Il fut tuer au combat, mais le souvenir des Mandaloriens se perpétua encore et encore, puisque l'armée de la république, clones de Fett portait des variantes de l'armure traditionnelle Mandaloriennes était issue du sang du derniers des Mandaloriens. Un autre de ces clones, Boba Fett, devint aussi chasseur de primes, ne se montrant jamais sans son armure et son casque qui autrefois appartenaient à Jaster Mereel.
Ainsi, malgré le fait que les Mandaloriens de "pure souche" furent tous éradiqués quelques années avant la guerre des clones, leur souvenir se perpétua à travers la galaxie pendant des décenies, contribuant à l'étoffement du mythe de ces mystérieux guerriers.